生殖器疱疹的传染源是患者及带病毒者，尤其是在患者的生殖器皮肤或粘膜的疱疹内含有单纯疱疹病毒，可通过性接触而传染给配偶或其他性侣，也可在同性恋者中互相传染。

有时在口腔或口腔周围患有疱疹的人，可通过口腔－生殖器性交，使对方传染生殖器疱疹。因此，不同方式的异性性行为，也可传播生殖器疱疹病。

由于有感染性的病毒能在潮湿的环境中存活数小时，因而单纯疱疹也可通过污染物而间接传播。

因为生殖器疱疹在潜伏中也有传染性，所以会让人在不知不觉成为疱疹的的传播者和受害者。

疱疹病毒在潜伏期时是存在于脊髓的神经中，生理上并不会有任何症状的，但是此时病毒就已经具有传染性了。而疱疹病毒发作后，会有阵阵刺痛、灼热感、皮肤溃烂和小伤口等症状出现， 并 且还会长水泡，严重时水泡还会出水，让患部又痛又痒。

在美国，平均有四分之一的人有性器官疱疹病毒潜伏在体内，其中只有五分之一的人知道自己已经患了疱疹。不过由于在潜伏期是没有任何症状的，所以这些患者就在不知道自己已经感染了疱疹的情况下，经由性接触时体液的交换将疱疹传染给别人。对成人来说，生殖器疱疹病毒并不会致命，可是患有疱疹的孕妇却可能在分娩的过程中把病毒传染给新生儿，而伤害新生儿的脑部，严重的话，还会夺走小宝宝的生命。

医生建议，不管你的性伴侣安不安全，健不健康，最好都要使用保险套，而且是全程使用；此外最好避免性伴侣复杂等情形，才可以避免的生殖器疱疹感染，而若是患了性疾病，也必须和性伴侣一起治疗，才不会一再互相传染，怎么治疗也治不好。